Для реєстрації в ДПС оновлених сертифікатів, коли ще діють попередні підписи, потрібно:

Подати форму J1391104 або F1391104 - "Повідомлення про надання інформації щодо кваліфікованого або удосконаленого електронного підпису, що базується на кваліфікованому сертифікаті електронного підпису".
Заповнюємо обов'язкові поля, в таблицю звіту вказуємо інформацію про новий ключ директора і новий ключ бухгалтера (співробітника), зберігаємо зміни.
Підписуємо спочатку новими ключами директора і бухгалтера (співробітника), які вказаний в табличній частині, потім підписуємо попереднім ще чинним ключем керівника і відправляємо в ДПС.
Отримуємо 2-ві позитивні квитанції - нові сертифікати зареєстровано.